Одним из распространенных видов сырья для гомеопатических препаратов являются вещества минерального происхождения: соли, металлы, камни. Не раз были предприняты попытки по классификации лекарств минерального происхождения, которая проводилась в соответствии с группами в периодической системе Д.И. Менделеева. Первым, кто попытался провести подобную классификацию, стал немецкий гомеопат Отто Леезер. Согласно исследованиям, проведенных Н.М. Вавиловой, существует сходство гомеопатических препаратов и токсического действия элементов.

Как и любые другие гомеопатические лекарства, препараты минерального происхождения стоит принимать в небольших дозах. Так препараты, содержащие ртуть, в крупных токсических дозах способны поразить кишечник с симптомами, сходными с дизентерией. Применение этих же лекарственных препаратов в небольших нетоксичных дозах служит для излечения дезинтериеподобных колитов. Если применение мышьяка вызывает холероподобный понос, то в минимальных дозах он способен вылечить сильнейшие поносы различного характера. Использование йода вызывает раздражение верхних дыхательных путей, а небольшие его дозы лечат катары и прочие заболевания дыхательной системы.